En annan stor förändring i status quo av livet av X-Män

Många nya funktioner infördes av Morrison, bland dem nedläggning av traditionella dräkter till förmån för en enhetlig Kevlar mögel nästan militären. Förändringen föreslogs av författaren att ge en mer realistisk ton till serien och markera en brytning med det förflutna. Dessutom, i början av hans administration, Morrison avslöjade vid mynningen av Beast att mänskligheten var avsedd att bli utrotade under loppet av några decennier för att ge plats för odling mutant befolkning Dark knight Kostymer
. Morrison utformat ett nytt hot mot barn atom: Cassandra Nova, den onda syster Professor X och kraftfull telepatiska. En annan stor förändring i status quo av livet av X-Män hände i slutet av den första bågen, när Xavier (som kontrolleras av Cassandra) visade i världen live-tv att vara en mutant. Skolan var så öppen för alla och olika X-Corporation bildades runt om i världen för att hjälpa mutant befolkningen i behov av hjälp. Uppenbarelsen av förekomsten av en skola för mutanter och dess öppning för allmänheten ändrade Xavier Institute of scenarier som officiellt blev en plats för undervisning fullständig utbildning av unga människor med de mest skilda krafter; tillhandahålla en ram för den andra serien av nya mutanter som lanserades under 2003, skriven av Nunzio DeFilippis makar och Christina Weir, starring den nya institutets studenter och en del av de tidigare medlemmarna i den första New Mutants som Danielle Moonstar, Wolfsbane Karma och nu lärare.

År 2001 var i stället lanserades serien Ultimate X-Män, de fick höra historien om unga mutanter tonåringar, inklusive Jean Grey, Cyclops Anime Sverige
, Storm, Beast och Iceman, i den så kallade Ultimate universum, den plats där de skrevs om månads berättelser om de stora Marvel-figurer. Affiancatasi i Ultimate Spider-Man och Ultimates, serien, ursprungligen skriven av Mark Millar och teckningar av bröderna Andy och Adam Kubert, var omedelbart en stor framgång, och föreslog revideringar av sagorna, händelser och klassiska karaktärer i ljuset av det nya millenniet.

Reload Initiativet kom igång med nedläggning av Marvel av Morrison, passerar mellan de rivaliserande DC Comics filer, öppnade en ny period för X-Män. Glasgow författare avslutade sin arbete på nya X-Män med uppståndelse Magneto sedan dödas av Wolverine, Jean Grey död återigen bli Phoenix och förstörelsen av New York City och i samma skola för begåvade Ungdomar Xavier. Redaktören Quesada beslutade då att det var dags för en ny väckelse för mutanten serien, skyldig att inte sälja än de borde ha, och detta motsvarade en förändring av de kreativa team på olika publikationer och till en omorganisation av serien och lag. X-Treme X-Män Claremont stängt sina dörrar och påslagen Uncanny X-Män förenade av konstnären Alan Davis, Austen tillsammans Larroca vidare New X-Män (som återvände till vara X-Män strax efter), att komma senare ersättas Peter Milligan från britterna 2005; Sedan kom huvudet Astonishing X-Män, skriven av den berömda filmregissör Joss Whedon och konstnären John Cassaday. Till skillnad som hade hänt under nittiotalet, de tre uppsättningar av varandra och detta ofta lett till uppenbara inkonsekvenser och motsägelser mellan de olika avdelningarna var helt oberoende: i själva verket samma månad man kunde hitta en svårt skadad tecken i en serie och engagerad i en kamp i en annan.

Tack vare den stora framgången och popularitet det avnjutas från det ögonblicket på karaktären av Wolverine, började författarna att förvandla det till en permanent närvaro i flera serier samtidigt Deadpool Kostymer
. I själva verket, förutom att vara en del av alla tre X-lag, blev också han medlem av New Avengers, som bildas efter händelserna i Avengers minisaga uppdelat. Den enda författare att ge tyngd åt quest'insensata utbredning var Claremont, vilket uteslöt honom från hans tomter och i andra tidningar fortsatte att visas regelbundet, dela sin tid mellan rollen som hjälte, professor och hyresgästen både av tornet i hämnarna att Xavier Institute.