Naruto Uzumaki är en ung pojke, som är tätad Kurama (Devetoopashatata Fox Demon). Tolv år innan historien, räv attacke Konoha- by gömd i bladen och dödade många människor. För att rädda Konoha från vissa undergång, ledaren för byn och ninjor i det - fjärde Hokage - offras för att försegla demonen i Naruto, på dagen för hans födelse. Invånare i Konoha, men behandlas Naruto som om han är en demon och undvikas under större delen av sin barndom. Tredje Hokage, som ersatte den fjärde efter hans död, passerade en lag som ingen nämner attacken på Fox på Konoha. Detta inkluderade Naruto, som inte var medveten om Naruto Costumes demon inom honom. År senare, är Naruto lurad av Mizuki förrädare ninja att stjäla en rulle av förbjudna metoder, men stoppades av sin lärare - Iruka Umino. Mizuki bryter mot förbudet att avslöja sanningen om försegla demonen så Naruto får reda på att han är stängd för Devetoopashatata Fox. När Iruka blev allvarligt sårad försvarar Naruto från Mizuki använde Naruto jutsu vad han lärt sig av scroll och skapar flera kloner av sig själv, Shadow Clone Technique, att besegra Mizuki.
Den huvudsakliga berättelsen följer Naruto och hans klasskamrater från Academy of Ninjas. Naruto befriends Sasuke Uchiha och Sakura Haruno, som tillsammans med honom i Team 7 under överinseende av begåvade ninja Kakashi Hatake. Liksom alla andra lag i byn måste Team 7 utför uppdrag och begär bönderna, till exempel, gör hushållsarbete eller ha livvakter någon. Efter flera uppdrag tillåter Kakashi laget att delta i Chuunin examen som tillåter dem att skaffa sig högre ranking och delta i svårare uppdrag. Under testet, Orochimaru - den mest önskade brottsling i Konoha, attackerade byn och dödar Tredje Hokage för hämnd. En av de tre legendariska ninjor - Dzhirayya har till uppgift att finna hans tidigare lagkamrater - Tsunade valt att bli den femte Hokage. Under sökningen visade att Orochimaru vill ta Sasuke på grund av sin enastående förmåga och genetiska arv. Att tro att Orochimaru kunde Naruto Costumes ge honom den styrka som krävs för att uppfylla sin hämnd på sin bror Itachi som dödade hela sin klan, Sasuke undvek honom. Tsunade sänder en grupp av ninja inklusive Naruto till Sasuke återvända till Konoha, men Naruto misslyckas i sina försök att besegra honom och föra honom tillbaka. Naruto inte ge upp och lämna Konoha att träna under de kommande två och ett halvt år med Dzhirayya som väktare, som förbereder sig för hans nästa möte med Sasuke.
